研究所的研究人員在會(huì)上表示，在利用新一代測(cè)序的基因檢測(cè)集合來篩查患者時(shí)，他們發(fā)現(xiàn)了一些意義不明的變異。
研究人員篩查了12名婦女，她們?nèi)狈?/span>BRCA1或BRCA2突變，但有著其他的乳腺癌相關(guān)突變。研究人員發(fā)現(xiàn)，其中8名婦女帶有意義不明的變異。之后，她們?cè)俅窝芯苛诉@些變異的意義，發(fā)現(xiàn)一些能夠被歸為良性，而另一些是可能有害的。
乳腺癌是*婦女的*殺手，大約有5-10%的癌癥是遺傳的。盡管BRCA1和BRCA2突變占了遺傳性乳腺癌病例的近半數(shù)，但是其他基因的變異也與疾病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)，這就給診斷帶來了挑戰(zhàn)。
除了開發(fā)BRCA1和BRCA2的基因檢測(cè)，研究人員還開發(fā)了一種名為Breast Cancer Panel 2（BCP2）的檢測(cè)，針對(duì)15個(gè)基因中的變異，包括ATM、CHEK2、PTEN、RAD50和TP53。
研究人員利用BCP2對(duì)12名缺乏BRCA1或BRCA2突變的婦女進(jìn)行篩查。她們從每名患者的外周血樣本中提取DNA，并在Thermo Fisher Ion PGM測(cè)序儀上進(jìn)行測(cè)序，之后通過Sanger測(cè)序來驗(yàn)證。根據(jù)獲得的報(bào)告，她們?cè)谖墨I(xiàn)中搜索那些結(jié)果可能意味著什么。
研究人員表示，報(bào)告可能是三種結(jié)果中的一種：陽(yáng)性結(jié)果，發(fā)現(xiàn)已知的致病變異；發(fā)現(xiàn)VUS；陰性結(jié)果，未發(fā)現(xiàn)任何已知的致病變異或VUS。不過，她指出，陰性結(jié)果也不一定是結(jié)論性的，因?yàn)閶D女可能在她們未檢測(cè)的基因中帶有突變。
在這項(xiàng)研究中，研究人員無法在4名患者的樣本中上找到臨床突變，而在另外8名患者中，她們發(fā)現(xiàn)了一個(gè)或多個(gè)基因帶有臨床意義不明的變異。其中，4名患者是ATM基因有VUS，而3名患者是PALB2基因有VUS。Torrezan表示，許多VUS是新生錯(cuò)義突變或次要等位基因頻率低的錯(cuò)義突變。
不過，研究人員補(bǔ)充道，一些VUS的狀態(tài)已經(jīng)改變。在她準(zhǔn)備演講稿時(shí)，再次進(jìn)行數(shù)據(jù)庫(kù)的搜索，發(fā)現(xiàn)PALB2和CHEK2中的VUS已經(jīng)被分別歸類為良性和危害性。她認(rèn)為，這也強(qiáng)調(diào)了計(jì)算機(jī)分析工具的重要性，必須保持?jǐn)?shù)據(jù)庫(kù)更新，并開展不同變異的功能研究，才能了解它們的意義。
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