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江蘇綠葉生物科技有限公司

蛋白質(zhì)定量的新方法

時(shí)間:2015-9-1閱讀:118
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    生物學(xué)研究離不開定量。對(duì)于定量,通常需要利用已知濃度的分子繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。zui近,研究人員介紹了一種新方法,能利用串聯(lián)質(zhì)譜儀對(duì)多個(gè)蛋白質(zhì)進(jìn)行定量。

    這種方法稱為MARQUISMultiplex Absolute Regressed Quantification with Internal Standards),依靠?jī)煞N現(xiàn)成的技術(shù):重同位素標(biāo)記的合成肽段以及質(zhì)譜的同位素標(biāo)記試劑。iTRAQTMT等試劑有著相同的分子量,但在質(zhì)譜儀內(nèi)產(chǎn)生特征的片段。

    在MARQUIS方法中,對(duì)于每個(gè)待定量的肽段,研究人員建立重同位素標(biāo)記的肽段。他們以不同的量混合這些肽段,并在組織或細(xì)胞裂解后立即將一種混合物加入每個(gè)生物樣品中。研究小組的負(fù)責(zé)人認(rèn)為:“這是關(guān)鍵的一步。你要盡早加入這些肽段,這樣重同位素標(biāo)記肽段和內(nèi)源肽段的損失可同時(shí)發(fā)生。"

    隨后以同位素試劑標(biāo)記樣品,并加入質(zhì)譜儀中。每個(gè)肽段產(chǎn)生兩個(gè)峰:“重"峰代表合成的(加標(biāo))肽段,而“輕"峰代表內(nèi)源性蛋白。通過(guò)定量前者碎片化所產(chǎn)生的標(biāo)記離子,研究人員能產(chǎn)生每個(gè)肽段的標(biāo)準(zhǔn)曲線。之后他們能測(cè)定對(duì)應(yīng)內(nèi)源性肽段的信號(hào),確定樣品中存在多少分子。

    研究小組利用MARQUIS定量了EGFR信號(hào)通路中的*磷酸化。在幾種配體刺激之后,他們?cè)诙鄠€(gè)時(shí)間點(diǎn)定量了EGFR網(wǎng)絡(luò)內(nèi)的磷酸化動(dòng)力學(xué),實(shí)現(xiàn)了EGFR磷酸化位點(diǎn)的定量比較,并證明了對(duì)于每種配體,受體磷酸化在性質(zhì)上相似,但數(shù)量上不同。他們還培養(yǎng)了膠質(zhì)母細(xì)胞瘤異種移植物,并應(yīng)用這種方法定量了EGFR激酶抑制的效果。

    有了這種方法,你就能看到那兒有多少靶點(diǎn),藥物是否命中靶點(diǎn),以及更重要的是,靶點(diǎn)抑制是否有效阻斷了下游的磷酸化。

    據(jù)介紹,MARQUIS能同時(shí)定量10個(gè)樣品中多達(dá)100種肽段。這只需要一臺(tái)串聯(lián)質(zhì)譜儀(如三重四級(jí)桿)、市售的同位素標(biāo)記試劑,以及重同位素標(biāo)記的合成肽段。每個(gè)人都能實(shí)現(xiàn)。我們希望創(chuàng)建出一種相當(dāng)簡(jiǎn)單的方法,而不需要什么訣竅。

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