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技術(shù)文章

使用合成核苷酸作探針實(shí)驗(yàn)

閱讀:286發(fā)布時(shí)間:2015-6-23

實(shí)驗(yàn)材料    核苷酸
試劑、試劑盒    SSC焦磷酸鈉SDS
儀器、耗材    培養(yǎng)箱水浴鍋
實(shí)驗(yàn)步驟    
1.  制備雙份的轉(zhuǎn)印細(xì)菌菌落或噬斑的硝酸纖維素濾膜(處理和干烤過(guò))。

2.  在室溫下用3× SDS / 0.1%SDS溶液500 ml 洗膜3~5次。

3.  然后在65℃洗膜至少1.5 h 以上直至過(guò)。
 
4.  在預(yù)雜交液中37℃預(yù)雜交1 h。
 
5.  在裝有20 ml 以上的SSC雜交液的可封口的雜交袋中可移入多達(dá)20張的濾膜。

6.  在毎 個(gè)雜交袋中每毫升雜交液加入0.125 ng 至1.0 ng 的每種32P標(biāo)記的寡核苷酸。

7.  在以下給定的溫度條件下寡核苷酸雜交14~48 h。

(1)14堿基——室溫

(2)17堿基——37℃

(3)20堿基——42℃

(4)23堿基——48℃
 
8.  從雜交袋中取出濾胰,用6×SSC / 0.05%焦磷酸鹽洗膜液在室溫冼膜3~5次,每次 5~15 min。

9.  再用預(yù)熱的洗膜液洗膜30 min。預(yù)熱溫度與寡核苷酸片段長(zhǎng)度有關(guān)。

(1)14堿基——37℃

(2)17堿基——48℃

(3)20堿基——55℃

(4)23堿基——60℃
 
10.  如果濾膜高于本底放射性活性,則需要將洗膜溫度升高2~3℃,并延長(zhǎng)洗膜15~ 30 min。

11.  重新作放射自顯影檢測(cè)。但不得超過(guò)以下對(duì)應(yīng)的溫度:

(1)14堿基——41℃

(2)17堿基——53℃

(3)20堿基——63℃

(4)23堿基——70℃
 
12.  用塑料薄膜包裹濾膜,放好,使用增感屏在-70℃對(duì)X光片曝光14~72 h,雙份濾膜均對(duì)X光片曝光,如果在同一位置出現(xiàn)曝光點(diǎn),那么該位置對(duì)應(yīng)的細(xì)菌菌落或噬斑為陽(yáng)性。
實(shí)驗(yàn)材料    寡核苷酸
試劑、試劑盒    LBSDSEDTATMAC
儀器、耗材    水浴鍋離心機(jī)培養(yǎng)箱尼龍膜
實(shí)驗(yàn)步驟    
1.  按“在氯化鈉/檸檬酸鈉中雜交"介紹的方法處理已影印細(xì)菌菌落的濾膜。

2.  按下列方法制備帶擴(kuò)增噬斑的濾膜

(1)從文庫(kù)中以漸減密度〔15 000~8 000噬斑 / 150 mm 平板)的方式將噬菌體鋪在瓊脂糖平板上。

(2)37 ℃培養(yǎng)至長(zhǎng)出可見(jiàn)的噬斑。

(3)將噬斑影印到硝酸纖維素濾膜或尼龍膜后,濾膜移至預(yù)熱的LB瓊脂糖平板上,37℃培 養(yǎng)5~12 h(轉(zhuǎn)印后冷室保存主平板)。

(4)將影印到膜上的噬菌體DNA變性并使之結(jié)合到濾膜上。
 
3.  轉(zhuǎn)印細(xì)菌菌落的濾膜按“在氯化鈉/檸檬酸鈉中雜交"的步驟1洗膜,然后將濾膜浸入50℃ 2×SSC / 0.5%SDS / 50 mmol/l EDTA,pH8.0溶液中洗滌,盡可能冼去濾膜上影印的細(xì)菌殘?jiān)?,然后用同洋的溶液再?遍。
 
4.  按每張濾膜5~10 ml 預(yù)溫的TMAC雜交液量,在15 cm 玻璃水晶盤中可移入多達(dá)30 張的濾膜,用塑料保鮮膜將玻璃盤封好。

5.  在雜交溫度下預(yù)雜交1 ~2 h。雜交溫度和洗膜溫度均應(yīng)比解鏈溫度低5~10℃。
 
6.  預(yù)雜交后,將濾膜轉(zhuǎn)移到一個(gè)裝滿新鮮、預(yù)熱的TMAC雜交液的雜交容器中。

7.  并按毎毫升雜交液加入1×106~2×106 cpm35P標(biāo)記的寡核苷酸探針,于適當(dāng)?shù)臏囟认聹赜?0~60 h。
 
8.  室溫下每張濾膜先用5~10 ml TMAC洗液洗滌,然后分別將濾膜轉(zhuǎn)移到200~ 250 ml 新鮮的TMAC洗液中,輕輕振蕩洗滌15 min。
 
9.  換上等體枳預(yù)熱的TMAC冼膜液,在適當(dāng)?shù)南茨囟认聹赜? h。

10.  再用等體積的2×SSC / 0.1%SDS洗膜液在室溫下洗膜,共3次,每次約10 min,以去除TMAC。

11.  zui后按“ 在氯化鈉/檸檬酸鈉中雜交"進(jìn)行放射自顯影。



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