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公司動(dòng)態(tài)

二型分子伴侶晶體和電鏡結(jié)構(gòu)

閱讀:326發(fā)布時(shí)間:2010-12-10

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分子伴侶素(Chaperonins)是一種ATP依賴的協(xié)助蛋白折疊的多亞基雙環(huán)復(fù)合物,在此之前,關(guān)于二型分子伴侶素核酸結(jié)合功能態(tài)的結(jié)構(gòu)以及功能循環(huán)各個(gè)環(huán)節(jié)中的構(gòu)象變化的研究都不是很透徹,其中zui為關(guān)鍵的因素就是沒(méi)有此類分子開口狀態(tài)的高分辨率結(jié)構(gòu)。該研究將冷凍電鏡三維重構(gòu)和X射線晶體學(xué)有效地結(jié)合在一起,獲得了*個(gè)開口狀態(tài)的二型分子伴侶3.7?分辨率的結(jié)構(gòu),對(duì)人們認(rèn)識(shí)此類分子的功能循環(huán)過(guò)程提供了非常關(guān)鍵的結(jié)構(gòu)信息。

 

該研究以來(lái)源于古菌Acidianus tengchongensis (AT) strain S5的二型分子伴侶素ATcpnβ為研究對(duì)象, 利用負(fù)染電鏡三維重構(gòu)的方法獲得了rATcpnβ的14 ?分辨率的閉合構(gòu)象,分析發(fā)現(xiàn)該構(gòu)象與先前報(bào)道的閉口狀態(tài)同源晶體結(jié)構(gòu)的單個(gè)亞基符合得非常好;同時(shí)利用低溫電鏡三維重構(gòu)方法,獲得了ATcpnβ apo狀態(tài)8.8 ?分辨率的三維結(jié)構(gòu)及ATP結(jié)合但未水解狀態(tài)的8.4 ?分辨率的三維結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)均呈現(xiàn)開口不對(duì)稱構(gòu)象,上環(huán)結(jié)構(gòu)較下環(huán)結(jié)構(gòu)閉合(但上環(huán)并不是*閉合的狀態(tài)),該構(gòu)象與先前報(bào)道的同源晶體結(jié)構(gòu)符合較差,特別是在頂端結(jié)構(gòu)域。

 

此外,研究人員經(jīng)過(guò)大量努力,獲得了ATcpnβ結(jié)合ADP的開口狀態(tài)的3.7?分辨率的晶體衍射數(shù)據(jù),以低溫電鏡結(jié)構(gòu)為模型,通過(guò)分子置換法解析了其晶體結(jié)構(gòu),獲得了*個(gè)具有9次對(duì)稱性的完整二型分子伴侶開口狀態(tài)的晶體結(jié)構(gòu),而此前只有8次對(duì)稱性的閉口狀態(tài)的原子分辨率晶體結(jié)構(gòu)。分析發(fā)現(xiàn),該晶體結(jié)構(gòu)的單個(gè)亞基能夠與rATcpnβ結(jié)合ATP(但未水解)的開口構(gòu)象非常好地吻合。通過(guò)比較開口構(gòu)象和閉合構(gòu)象,較為準(zhǔn)確地觀察到二型分子伴侶在從ATP結(jié)合到ATP水解過(guò)程的精細(xì)構(gòu)象變化——整個(gè)亞基作為剛體向內(nèi)的翻轉(zhuǎn)運(yùn)動(dòng)和頂端區(qū)相對(duì)于赤道結(jié)構(gòu)域~30度的旋轉(zhuǎn)。

 

此前由于缺乏高分辨率的晶體結(jié)構(gòu),有些研究認(rèn)為分子伴侶的腔體關(guān)閉僅僅與lid結(jié)構(gòu)域的運(yùn)動(dòng)有關(guān),另一些研究則認(rèn)為是整個(gè)亞基向內(nèi)的運(yùn)動(dòng)所致,該研究獲得的高分辨率晶體結(jié)構(gòu)解決了這些爭(zhēng)議,提供了zui為準(zhǔn)確的構(gòu)象變化過(guò)程。

 

此外,該研究成果充分表明了將電鏡三維重構(gòu)與X射線晶體學(xué)結(jié)合在一起對(duì)于研究生物超分子復(fù)合體的結(jié)構(gòu)、闡述生物問(wèn)題的巨大優(yōu)勢(shì),這也是結(jié)構(gòu)生物學(xué)發(fā)展的一個(gè)重要趨勢(shì)。此前,由于技術(shù)條件的限制,國(guó)內(nèi)的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究主要以X射線晶體學(xué)為主,電鏡和晶體學(xué)結(jié)合的成功例子很少;現(xiàn)在,國(guó)內(nèi)在電鏡三維重構(gòu)技術(shù)方面給以巨大投入,該研究無(wú)疑是在這種局勢(shì)下的一個(gè)成功范例。

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