生物通報道：《Nature Methods》盤點2011年度技術，選出了zui受關注的技術成果：人工核酸酶介導的基因組編輯（genome editing with engineered nucleases）技術。 
除了進一步編輯以外，《Nature Methods》也整理出了2011年zui值得關注的幾項技術，分別為：單細胞技術（Single-cell methods）、功能基因組資源（Functional genomic resources）、糖蛋白組學（Glycoproteomics）、單倍體因果突變（Causal mutations in a haploid landscape）、單層光生物成像（Imaging life with thin sheets of light）、非模式生物（Non–model organisms）、光基礎電生理學（Light-based electrophysiology）和RNA結構（RNA structures ）。
蛋白質(zhì)組學（proteomics）無疑已經(jīng)成為了功能基因組學研究的重點，目前已經(jīng)能夠快速準確的提取并鑒定蛋白，甚至達到了高通量飛克分子量（fmol）數(shù)量級。但是一個成熟蛋白質(zhì)的生物學活性需翻譯后修飾，這些修飾對于了解蛋白功能具有十分重要的意義，其中糖基化修飾是zui重要的修飾方式之一，因此糖蛋白組學（Glycoproteomics）應運而生。
由于糖基化在多種生物學過程中起重要作用，比如細胞調(diào)控，免疫應答等，而且更加重要的是這種修飾方式還參與了正常細胞轉化為腫瘤細胞的信號轉導過程，因此科學家們對于糖蛋白組學十分感興趣，但是目前這一領域的技術方法卻嚴重缺乏，尤其是在幾個方法學技術方面。
首先作為一個翻譯后修飾過程，糖基化從定義上來說是屬于非模板性的，與其它簡單的翻譯后修飾，比如磷酸化不同，多聚糖結構存在極大的差異，導致其分析尤為困難。一個簡單的蛋白可以有上十種，上百種不同的多聚糖修飾基團，而且蛋白糖基化修飾在細胞中豐度低，自我修飾化學計量數(shù)也低。
其次目前糖蛋白組學研究領域，以及蛋白質(zhì)組學研究領域常常分屬于不同的領域，糖蛋白組學研究人員分析多聚糖結構，但忽略了其來源蛋白主體本身，而蛋白質(zhì)組學研究人員分析蛋白，卻忽略了其上附著的多聚糖。不過現(xiàn)在科學家們也越來越認識到了整體研究的重要性，蛋白質(zhì)組學研究人員近期還報道了利用高通量方法，檢測蛋白糖基化位點的新成果——雖然這還不是多聚糖結構的相關成果。糖蛋白組學研究組也開始集中分析單個蛋白上出現(xiàn)的所有多聚糖結構——雖然這還并不是高通量分析。
質(zhì)譜技術已經(jīng)成為了蛋白質(zhì)組學研究中的一種成熟技術，也同樣在糖蛋白組學中扮演重要角色，蛋白鏈和多聚糖鏈之間存在顯著的化學特性差異，這帶來了測序挑戰(zhàn)，但高分辨率質(zhì)譜分析儀器，以及一些更*的片段分析方法能幫助我們，除此之外，質(zhì)譜分析之前的糖蛋白分離和純化，以及之后的生物信息學分析也是重要的技術之一。
商業(yè)性的相關產(chǎn)品儀器不少，比如賽默飛世爾的Thermo Scientific LTQ Orbitrap組合式質(zhì)譜儀在蛋白質(zhì)組學，即蛋白質(zhì)及其在生物體系中的結構和功能的大規(guī)模研究方面發(fā)揮了重要作用，可以說是識別完整蛋白和酶消化蛋白、找到發(fā)生化學修飾的蛋白及識別修飾的類型和位點的重要儀器之一（?。篖TQ Orbitrap組合式質(zhì)譜儀技術資料>> >>）。
2011年糖蛋白組學研究也獲得了不少成果，比如研究人員確定了一種能夠產(chǎn)生糖蛋白的酶的結構，化學修飾中zui頻繁的與天冬酰胺相連的糖基化，是由低聚糖轉移酶（OST）催化的，這種酶是位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中的一種膜蛋白復合物，研究人員完成了這種酶與一個受體肽形成復合物的細菌OST的X射線結構測定，為了解酰胺態(tài)氮激發(fā)和糖基化提供了分子基礎，也為糖蛋白和復合糖治療藥物的生成提供了新思路。
（生物通：萬紋）
原文摘要：
Glycoproteomics
Allison Doerr 

Technologies for profiling the proteome and even simple post-translational modifications such as phosphorylation are approaching maturity, but the most abundant post-translational modification, glycosylation, still remains practically unexplored at the proteome scale. This is not for lack of interest but because of a dearth of methods for profiling the enormously complex glycoproteome.

來源：生物通