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2011值得關(guān)注的技術(shù):RNA結(jié)構(gòu)

時間:2012-1-12閱讀:375
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生物通報道:《Nature Methods》盤點2011年度技術(shù),選出了zui受關(guān)注的技術(shù)成果:人工核酸酶介導(dǎo)的基因組編輯(genome editing with engineered nucleases)技術(shù)。 
除了進(jìn)一步編輯以外,《Nature Methods》也整理出了2011年zui值得關(guān)注的幾項技術(shù),分別為:單細(xì)胞技術(shù)(Single-cell methods)、功能基因組資源(Functional genomic resources)、糖蛋白組學(xué)(Glycoproteomics)、單倍體因果突變(Causal mutations in a haploid landscape)、單層光生物成像(Imaging life with thin sheets of light)、非模式生物(Non–model organisms)、光基礎(chǔ)電生理學(xué)(Light-based electrophysiology)和RNA結(jié)構(gòu)(RNA structures )。
RNA結(jié)構(gòu),尤其是RNA轉(zhuǎn)錄復(fù)合物的結(jié)構(gòu)研究,已經(jīng)引起了不少科學(xué)家們的關(guān)注,2011年RNA結(jié)構(gòu)分析方法取得了一些重要進(jìn)展。
雖然RNA轉(zhuǎn)錄體合成的時候是線性結(jié)構(gòu),但是其折疊后的結(jié)構(gòu)在細(xì)胞生理機(jī)制作用中扮演了重要角色?,F(xiàn)代生命科學(xué)研究表明,RNA的作用遠(yuǎn)不止是信使,傳遞信息,或者作為核糖體中的RNA成分。像是RNA剪接和編輯,維持端粒,蛋白分泌表達(dá),小分子感應(yīng)和應(yīng)答催化,都是近年來發(fā)現(xiàn)的RNA的新功能。RNA如何行使這些功能,是解開許多生物學(xué)作用迷題的關(guān)鍵,而要回答這個問題,常常需要依賴于解密RNA結(jié)構(gòu)。
但是要了解RNA的結(jié)構(gòu),并不容易,許多RNAs保守性不高,其功能不能通過簡單的同源篩選就可以發(fā)現(xiàn),因此常常采用的是二級保守結(jié)構(gòu)的公變分析,還可以用于功能三維RNA模塊的計算機(jī)模擬預(yù)測。首先為了解密RNA二級結(jié)構(gòu),研究人員采用了一些高通量的實驗方法,2011年麻省理工大學(xué)布羅德學(xué)院開發(fā)了一種高分辨率新技術(shù),可以瞄準(zhǔn)一個特定細(xì)胞,研究所有RNA的變化過程。通過在極短的時間間隔內(nèi)給RNA拍攝快照,并將這些照片連在一起,不僅能顯示出RNA的數(shù)量變化,還能看到其生命周期中短暫的中間過程。研究小組將這種追蹤新生RNA生命周期的技術(shù)與一種新的測序技術(shù)結(jié)合,就能計算出mRNA(信使RNA,攜帶遺傳信息,在蛋白質(zhì)合成時充當(dāng)模板)的數(shù)量。
這一新技術(shù)的一個關(guān)鍵應(yīng)用是跟蹤如癌癥或其他影響到RNA生命周期的疾病中的基因突變。過去人們只知道發(fā)生了突變,而要看到細(xì)胞里分子過程中所發(fā)生的突變結(jié)果卻非常困難。新技術(shù)能讓研究人員深入透視到細(xì)胞內(nèi)部,看到基因突變?nèi)绾螖_亂了RNA的數(shù)量水平,反過來又合成了哪種蛋白質(zhì)。
(生物通:萬紋)
原文首段:
RNA structures
 
Although synthesized as linear polymers, RNA transcripts fold into intricate structures crucial for cellular physiology. It is now evident that RNA functions extend far beyond the established roles of messenger, transfer and ribosomal RNAs, with examples in RNA splicing and editing, omere maintenance, protein secretion, small-molecule sensing and reaction catalysis, to name just a few. How RNA achieves its arsenal of functions with a limited assortment of building blocks is a question of great interest, and the answer often lies in deciphering RNA structure at its different levels of complexity.

 

來源:生物通

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