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細胞STR鑒定背景介紹:
在過去的 45 年里,細胞生物學方面的數(shù)據(jù)一直在發(fā)表,但是應(yīng)用于生物醫(yī)學研究領(lǐng)域的哺乳動物細胞被錯誤鑒定和交叉污染的問題,一直是一個普遍存在的突出問題。早在1970年代,一項研究就發(fā)現(xiàn),被廣泛使用的Hela細胞系就曾被污染,這一事件當時就促使*細胞系質(zhì)量控制手冊的誕生。HeLa細胞株是由正常子宮頸細胞被一 人類乳突狀瘤病毒(Human Papillomavirus 18或HPV18)轉(zhuǎn)型成癌細胞的,而且和正常子宮頸細胞有許多不同。
從那時候開始,細胞身份鑒定成 一個受科學家關(guān)注的問題,也是從那時候開始越來越多的細胞被污染事件開始出現(xiàn)。人們已經(jīng)開始意識到細胞被污染的問題,導致細胞交叉污染的原因和預(yù)防措施也已經(jīng)被公布,然而問題卻一直有增無減,研究人員繼續(xù)發(fā)表從錯誤鑒定和交叉污染的細胞系所獲取的數(shù)據(jù)。
據(jù)估計, 國外實驗室已建株細胞有接近 20% 存在上述問題, 有 15-25% 的研究論文因為使用了被錯誤辨識和交叉污染的細胞而導致錯誤的結(jié)論。這造成大量研究經(jīng)費的浪費,并產(chǎn)生了大量無效或錯誤數(shù)據(jù)。
2008年,Josephine Nefkens研究所的分子生物學家Winand Dinjens與同事發(fā)現(xiàn)食管腺癌細胞其實與食管扁平細胞癌細胞系具有相似的基因型。這些結(jié)果促使他們開始關(guān)注細胞身份問題。 Dinjens開始驗證這些細胞系,將它們與原始的組織進行基因型比對,結(jié)果發(fā)現(xiàn),這些細胞系與原始組織細胞已經(jīng)有不同的基因型。
在13株食管腺癌細胞系中,其中3株:SEG-1,BIC-1和SK-GT-5被污染,這些細胞株混合有其他癌細胞。這些細胞系已經(jīng)被多家實驗室應(yīng)用在兩個臨床試驗、并發(fā)表了超過100篇SCI文章,并申請了11個美國,這一研究結(jié)果被發(fā)布在一期的Journal of the National Cancer Institute(JNCI)。
2007 年 NIH發(fā)布了通知,強烈建議在使用培養(yǎng)細胞的時候進行鑒定(authentication)。2008 年底,專家提議ATCC致力于人源細胞系的鑒定工作,并制定鑒定的標準程序。
近年來,大量研究表明 STR 基因分型 方法是進行細胞交叉污染和性質(zhì)鑒定的zui有效和準確的方法之一,STR基因分型應(yīng)用于細胞鑒定已被ATCC等機構(gòu)強烈*。美國的ATCC 細胞庫、德國的DSMZ細胞庫以及日本的JCRB細胞庫等為STR 分型提供了各細胞株的數(shù)據(jù)供比對。
標準的制定:
2011年初,美國菌種保藏中心(ATCC)制定了人源細胞系STR鑒定標準,旨在約束因細胞交叉污染和錯誤辨識所導致的無效科研數(shù)據(jù)的不斷擴增。更重要的是,細胞系的鑒定在研發(fā)基于細胞下的醫(yī)學產(chǎn)品時起到至關(guān)重要的作用,它能避免將人體細胞暴露于錯誤鑒定細胞中的風險。
您是否有過這樣的經(jīng)歷……
在科研工作結(jié)束之際,被你所投稿的雜志要求提供細胞鑒定報告,而此時你研究中使用的細胞是否被污染,將決定你幾個月甚至長達幾年的科研工作的成敗。
您是否有過這樣的經(jīng)歷……
新買到的細胞、實驗室傳了幾代的細胞,又或者儲存于超低溫冰箱幾年不用的細胞, 被污染了么? 鑒定正確么?用它做研究會影響實驗結(jié)果么?
沒有經(jīng)過相應(yīng)的細胞鑒定,使用了被污染的細胞,花費了大量的時間、物力和人力,寫出了一篇論文,但是結(jié)論被推,論文被召回,大量的時間、物力和人力都被浪費,一切都要從頭再來。如果你是等待畢業(yè)的學生,等待你的將是延期畢業(yè)。
選擇正確的細胞,是實驗成功的一半
細胞是一種很特殊的商品,由于其具有可復制性,因此很容易被一些商家自行復制后再出售,而這些自行傳代復制的細胞幾乎*,所以很容易引起大家購買。但是這些細胞傳代的次數(shù)、培養(yǎng)的條件以及是否有污染等都無法得到保障,甚至有老師買了這種細胞做了很多的實驗都沒有結(jié)果,很長時間之后才發(fā)現(xiàn)細胞被污染了。
大部分生物實驗都需要一個大量的時間、精力和金錢的過程,為了讓您的時間、精力、財力不會因為使用了錯誤的細胞而浪費,我們建議您在實驗之前,對您所使用的細胞進行細胞鑒定,以確保您使用的細胞的正確性,讓您的實驗有一個良好的開端。
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