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血標(biāo)本提取RNA

時(shí)間:2019/3/19閱讀:4733
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在用血液標(biāo)本進(jìn)行基因表達(dá)研究時(shí),需要及時(shí)把新鮮血液中有核細(xì)胞的RNA提取出來(lái)。全血還不能直接放到-80℃保存,即使在-80℃保存,全血中的RNA也容易發(fā)生降解。傳統(tǒng)的提取新鮮全血RNA方法是把先把有核細(xì)胞從全血中分離出來(lái),需要加白細(xì)胞分離液、離心等步驟,比較繁瑣,在臨床醫(yī)院往往難以實(shí)施,新的RNA提取方法為RN01 TRIpure LS裂解全血提取RNA。

(一)淋巴細(xì)胞分離液分離單個(gè)核細(xì)胞:
外周血及骨髓(抗凝)利用淋巴細(xì)胞分離液分離單個(gè)核細(xì)胞
(1)外周血送檢需5-10ml抗凝血,骨髓需1-3ml抗凝,常溫送檢(樣本量根據(jù)單個(gè)核細(xì)胞的數(shù)量來(lái)確定,一般需要5x106單個(gè)核細(xì)胞以上)。
(2)加入等體積無(wú)菌PBS于外周血及骨髓中充分混合,形成細(xì)胞懸液;
(3)加入5ml淋巴細(xì)胞分離液于另一離心管。
(4)吸取5ml細(xì)胞懸液沿管壁輕輕加入到淋巴細(xì)胞分離液表面(注意勿與淋巴細(xì)胞分離液混合)。離心1500rpm 20min。
(5)用吸管輕輕吸出界面層(白膜)中的MNC入另一離心管中。無(wú)菌冷PBS洗2次,后1次洗滌可以將細(xì)胞懸液移入EP管中,離心去上清直接或加入TRIzol混勻后-70℃凍存,或直接提取RNA(可以先進(jìn)行細(xì)胞計(jì)數(shù)以保證細(xì)胞數(shù))。

(二)紅細(xì)胞裂解液分離單個(gè)核細(xì)胞:
(1)血液收集:用肝素抗凝,因?yàn)镋DTA可能會(huì)對(duì)后續(xù)的pcr有影響,因?yàn)镋DTA會(huì)螯合pcr反應(yīng)中的Mg2+,也可以根據(jù)實(shí)驗(yàn)的具體要求看選擇怎么樣的抗凝。
(2)白細(xì)胞的分離:一般選擇1.5ML新鮮的血液,或選取冷凍的5ML的血液(冷凍血液的保存:先液氮速凍,再置于-80°保存),或隔天的5ML的血液,就可以分離到比較多的白細(xì)胞了??梢赃x擇溶紅素或紅細(xì)胞裂解液按一定的比例(1:3或1:5)分離白細(xì)胞,一般在3500轉(zhuǎn)離心6分鐘即可,效果不好的話,可以重新裂解一次。
(3)分離得到的白細(xì)胞,立刻用質(zhì)量好的TRIZOL裂解白細(xì)胞,如果不能馬上提取的話,可以置于-20或-80保存,過(guò)后抽提(選擇一般的組織或細(xì)胞的RNA抽提ELISA試劑盒即可)。

(三) RN01 TRIpure LS裂解全血提取RNA
液體樣本RNA提取試劑RN01 TRIpure LS??梢灾苯恿呀馊崛NA,避免了先裂解白細(xì)胞可能導(dǎo)致的RNA降解,也大大簡(jiǎn)化了操作步驟。操作時(shí)間比普通方法節(jié)約至少三分之一。

(1)在臨床上采血時(shí),可以先把TRI pure LS Reagent分裝750ul到1.5ml的離心管中。
(2)血液樣本可以先抗凝處理(EDTA抗凝或者其他抗凝方式都可),然后取250ul全血樣品加入到750ul的TRI pure LS Reagent中,用移液槍反復(fù)抽打并振蕩混勻,在室溫裂解5min-10min,直至血細(xì)胞充分發(fā)生裂解。
(3)此裂解液保存在-20℃下可達(dá)2個(gè)月,-80℃可達(dá)半年,4℃可以1天。
(4)樣品在15 -30°C條件下孵育5分鐘以使核蛋白體*分解。
(5)每1ml TRIpure加0.2mllv仿,蓋緊樣品管蓋,用手用力搖晃試管15秒并將其在室溫下孵育2~3分鐘。在2~8°C下以不超過(guò)12,000×g的離心力高速冷凍離心15分鐘。離心后混合物分成三層:下層苯酚-lv仿層,中間層,上層無(wú)色的水樣層。RNA在于水樣層,水樣層的容量大約為所加TRIpure 容量的60%。
(6)將水樣層轉(zhuǎn)移到新EP管中(如果希望分離DNA和蛋白,有機(jī)層同樣要予以保留),初均化時(shí)的每1ml TRIpure 對(duì)應(yīng)0.5ml異丙醇,將混合的樣品在-15 -30°C條件下孵育10分鐘;
(7)在2~8°C下以不超過(guò)12,000×g的離心力高速冷凍離心10分鐘(RNA沉淀在離心前通常不可見,形成一膠狀片狀沉淀附著于試管壁和管底;
(8)移去上層懸液。用75%的乙醇洗滌RNA沉淀一次(每1ml的TRIpure 至少加1ml的75%乙醇),在2~8°C下以不超過(guò)7,500×g的離心力高速冷凍離心5分鐘;
(9)簡(jiǎn)單干燥RNA沉淀(空氣干燥或真空干燥5~10分鐘,不能讓RNA沉淀*干燥那樣會(huì)極大地降低它的可溶性)。部分溶解的RNA樣品其A260/280比值<1.6。用移液管尖分幾次移取無(wú)RNA酶的水或0.5%SDS溶液來(lái)溶解RNA,RNA還能被100%甲酰胺(除去離子)再溶解并保存在–70°C;

 

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