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南京森貝伽生物科技有限公司

PCR實(shí)驗(yàn)方法

時(shí)間:2013-3-12閱讀:764
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實(shí)驗(yàn)室常用 DNA 合酶有三  種 TaKaRa TaqT M TaKaRa EX TaqT M 和 Pyrobest T M DNA Polymerase 。TaKaRa TaqT M 是一般的 DNA 聚合酶真性較 , 但價(jià)錢便宜,般用于基因表達(dá)的檢測(cè)等。TaKaRa EXTaqT M 是具有 Proof reading 活性的耐熱性 DNA 聚合酶有一定的保真性,且其擴(kuò)增得到的 PCR 產(chǎn)物 3’ 個(gè) A 如果希望接將產(chǎn)物  T-vector 此酶。 Pyrobest T M DNA Polymerase 也是具有 Proof reading 活性的耐 DNA 聚合酶, 其特點(diǎn)是保真性*,擴(kuò)增得到的 PCR 產(chǎn)物為平滑末端。如果進(jìn)行基因的擴(kuò)增 請(qǐng)使用此酶。

1.   按下列組成在 PCR 反應(yīng)管中調(diào)制反應(yīng)液:

TaKaRa TaqT M  TaKaRa EXTaqT M 的配方

 

 

Reagent

 

Quantity, for 50µ l of reactiomixture

10X PCR buffer Mg2+ free

 

µ l

 

 

 

 

MgCl225mM

 TaKaRa TaqT M  µ l

 TaKaRa EXTaqT M  µ l

 

2.5mM dNTP mix

 

µ l

10µ M Prime 上游

 

µ l

10µ M Primer 下游

 

µ l

 

Templa te DNA

 

µ l

Taq  EX TaqDNA Polymerase

 

0.25 µ l

 

Sterile deionized water

 

Up to 50µ l

 

Total

 

50 µ l /Sample

Pyrobest TM DNA Polymerase 的配方

 

 

Reagent

 

Quantity, for 50µ l of reactiomixture

 

10X Pyrobest buffer

 

5µ l

 

2.5mM dNTP mix

 

4µ l

10µ M Primer 上游

 

1µ l

10µ M Prime 下游

 

1µ l

 

Templa te DNA

 

1µ l

 

Pyrobest TM DNA Polymerase

 

0.25µ l

 

Sterile deionized water

 

Up to 50µ l

 

Total

 

50µ l /Sample

 

 

① 反應(yīng)總體積根據(jù)實(shí)際情況進(jìn)行調(diào)控,可以做 20~50µ l 以節(jié)約試劑;

② 將上表各成分加入到 0.2ml  0.5ml 滅菌的 PCR 薄壁管中;

③ 如果不用 PCR 儀的加熱蓋,在反應(yīng)混合液的上層加 30 ~50µ  的礦物油 防止樣品在 PCR 的過程中蒸發(fā);

 

2.   按以下程序進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增。

 

 

PCR 反應(yīng)條件視模板、引物等結(jié)構(gòu)條件同而各異,在實(shí)際操中需根 據(jù)具體的情況以及 PCR 結(jié)果而進(jìn)行優(yōu)化。

 

 

 

Step

 

Temperature,

 

° C

 

 

Time, min

Number of cycles

 

Note

起始變 性

 

 

94~95

 

 

1-3

 

 

1

 

變性

 

94~95

 

0.5-2

 

 

 

 

 

 

25-35

退火溫度比理論退火 溫度大概低 5°C,再 根據(jù)反應(yīng)結(jié)果優(yōu)化

 

退火

 

 

37-70

 

 

0.5-2

 

延伸

 

 

70-75

據(jù)擴(kuò) 增產(chǎn)物 的大小

每分鐘延伸 1000bp

zui終延 伸

 

 

70-75

 

 

10

 

 

1

 

 

 

反應(yīng)結(jié)束后,抽取擴(kuò)增樣品 5µ l,用瓊脂糖凝膠電泳分析擴(kuò)增結(jié)果,用

DNA marker 判斷擴(kuò)增片段的大小或冷凍保存,以備以后分析使用。

 

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