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裂殖酵母采用多種末端連接法修復DNA損傷
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- 【資料簡介】
裂殖酵母采用多種末端連接法修復DNA損傷
報道了一個在裂殖酵母中檢測染色體上進行的末端連接修復的方法,并利用此方法分析了機理不同的三類末端連接修復方式。非同源末端連接(NHEJ)是哺乳動物中修復DNA雙鏈斷裂的主要方式。參與NHEJ的修復蛋白如Ku,ligase IV,XLF,和X家族DNA聚合酶在裂殖酵母中都是保守的。通過表達一個高特異性的核酸內切酶來產生基因組上一個特定位置的雙鏈斷裂,作者建立了結合傳統測序和高通量測序全面分析不修復產物序列的方法,對突變體中修復產物序列的分析驗證了Ku,ligase IV和XLF在經典NHEJ中的核心作用,以及X家族DNA聚合酶Pol4在間隙*(Gap Filling)中的重要作用。研究發(fā)現在Ku或ligase IV缺失的突變體中,兩種非NHEJ的另類末端連接仍能發(fā)生。其中一種方式利用了DNA斷裂位置兩側的微同源(microhomology)序列并造成幾百至幾千堿基的缺失,另外一種方式則只在酶切位點處引入堿基置換。
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