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限制性內(nèi)切酶(restriction enzyme)酶譜分析

時(shí)間:2015/9/30閱讀:460
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一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/strong>
在DNA上以限制性內(nèi)切酶的酶切位點(diǎn)作為標(biāo)記所繪制的物理圖譜就是限制性內(nèi)切酶圖譜,限制性內(nèi)切酶圖譜與其他相關(guān)資料聯(lián)合使用,可用于基因克隆、分離和基因功能研究。
二、實(shí)驗(yàn)原理
(一)酶切圖譜的構(gòu)建
限制性內(nèi)切酶在DNA上有特異的識(shí)別和切割位點(diǎn),可將DNA切開(kāi)而得到兩個(gè)或兩個(gè)以上的大小不同的片段,這些片段可通過(guò)電泳分離并檢測(cè)其大小。雙酶切法酶切圖譜構(gòu)建是使用兩種不同的限制性內(nèi)切酶對(duì)同一個(gè)DNA分子進(jìn)行單酶切和雙酶切,將所得的片段進(jìn)行對(duì)比組裝,對(duì)交替區(qū)域進(jìn)行加減以確定酶切位點(diǎn)的相對(duì)位置。
假如n代表某限制性內(nèi)切酶在DNA上的酶切位點(diǎn)數(shù),F(xiàn)代表*酶切后的片段數(shù),則線形DNA單酶切后:F=n+1,而環(huán)狀DNA單酶切的F=n。若使用雙酶切時(shí),所得的片段中有兩類:一是與單酶切片段*相同的保留片段:二是單酶切片段備再切割后小片段,這些的片段的分子量之和等于單酶切片段的分子量。將以上片段電泳后,遵循以下“三三"規(guī)則進(jìn)行分析:
1、區(qū)分三類片段,并做好標(biāo)記:
(1)消失片段Fd(Disppeared fragment),即單酶切片段經(jīng)雙酶切后消失的片段。
(2)保留片段Fr(Remaiined fragment),即單酶切片段經(jīng)雙酶切后仍保留的片段。
(3)接頭片段Fl(Linker fragment):即雙酶切后出現(xiàn)的新片段,由Fd再切割而來(lái)。
2、分析三類片段的關(guān)系:
(1)兩種酶的Fd總數(shù)相同,而Fr總數(shù)不等。
(2)Fd的片段總數(shù)為的1/2。
(3)兩種酶Fl的相同。
3、排列三類片段,構(gòu)建酶切圖譜:
(1)首尾排列:每種酶Fd的片段的首尾只能接Fl片段。
(2)夾心排列:一種酶的Fr片段只夾于另一種酶的兩個(gè)Fl片段中間。
(3)鑲嵌排列:兩種酶的Fd段彼此鑲嵌排列,由共同的Fl片段連接。
此外,應(yīng)注意:
① 若*種酶的單酶切片段數(shù)為F1,第二種酶切片段數(shù)為F2,雙酶切的片段數(shù)為F,則線形DNA的F=(F1+F2)-1,而環(huán)狀DNA的F=F1+F2。
② Fd通常等于幾個(gè)Fl之和。
(二)重組子的酶切分析
重組子是插入了外源DNA片段的載體分子。與空載的載體相比,其酶切圖譜出現(xiàn)了變化。所以,檢測(cè)疑是重組子的酶切圖譜可以幫助確定是否是真的重組子,并可以確定插入片段的插入方向,為基因克隆的結(jié)果鑒定和進(jìn)一步的操作提供依據(jù)。
三、實(shí)驗(yàn)內(nèi)容
(一)酶切圖譜的構(gòu)建
1、用兩種限制性內(nèi)切酶分別對(duì)同一DNA分子進(jìn)行*單酶切。
2、取適量的單酶切產(chǎn)物用另一種酶進(jìn)行*酶切,得到雙酶切產(chǎn)物。
3、將以上酶切產(chǎn)物進(jìn)行電泳,然后分析電泳結(jié)果,構(gòu)建這兩種的酶切圖譜。
(二)重組子的酶切分析
1、提取疑是重組子的DNA,并用適當(dāng)?shù)南拗菩詢?nèi)切酶進(jìn)行酶切。同時(shí)做非重組子對(duì)照。
2、分析酶切產(chǎn)物的電泳結(jié)果,繪制酶切圖譜,判斷是否是真重組子。
四、注意事項(xiàng)
1、實(shí)驗(yàn)前必須查閱相關(guān)資料,了解和掌握雙酶切法的原理和構(gòu)建圖譜的方法。根據(jù)所提供的材料設(shè)計(jì)詳細(xì)的實(shí)驗(yàn)步驟,以達(dá)到的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
2、實(shí)驗(yàn)中應(yīng)確保*酶切,并獲得良好的電泳分離結(jié)果。
3、重組子分析時(shí)應(yīng)在了解插入片段的一般資料的基礎(chǔ)上確定所需的限制性內(nèi)切酶,并對(duì)酶切結(jié)果作出預(yù)期;zui后用實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證。

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