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蛋白質(zhì)特定位點(diǎn)N-H鍵活化組氨酸作為定位基團(tuán)

時(shí)間:2016-7-19閱讀:216
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多肽的化學(xué)修飾對于藥物研發(fā)、生物材料以及生物分子探針的設(shè)計(jì)意義重大。但是,大部分針對多肽或者蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)修飾都局限于支鏈的改造。我們知道,自然界經(jīng)過億萬年的進(jìn)化,能夠神奇的對蛋白質(zhì)或者肽鏈的某一特定位置進(jìn)行修飾(如乙?;⒓谆龋?,這種看似簡單的操作對于生存卻意義重大,這種微小的結(jié)構(gòu)變化對于穩(wěn)定蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)以及通過選擇性識別蛋白-蛋白相互作用來抑制某些酶的活性。比如細(xì)菌通過N-甲基化調(diào)控自身產(chǎn)生抗生素,生物體內(nèi)組蛋白的乙酰化水平與腫瘤的產(chǎn)生息息相關(guān)。

目前多肽中氨基的烷基化或者芳基化仍存在很大挑戰(zhàn)。盡管可以用非自然的氨酰-tRNA合成酶來實(shí)現(xiàn)非自然肽鏈的合成,但使用N-取代的非天然氨基酸的報(bào)道非常有限。固相合成是另一種很好的取代方法,但是一旦涉及到N-烷基取代的氨基酸,往往兼容性就出現(xiàn)問題。而關(guān)于肽鏈骨架氨基的直接修飾方法就更少了。基于此,美國萊斯大學(xué)的Zachary Ball(有機(jī)牛人Barry M. Trost的學(xué)生)課題組開發(fā)了二價(jià)銅催化的肽鏈骨架N-H鍵活化(組氨酸定位基團(tuán))。(Histidine-Directed Arylation/Alkenylation of Backbone NH Bonds Mediated by Copper(II). J. Am. Chem. Soc., 2016, 138, 7472-7475, DOI: 10.1021/jacs.6b03390

首先,作者用短鏈蛋白質(zhì)促甲狀腺激素釋放激素(TRH,下圖中1)作為模型,在NMM緩沖液中,芳基硼酸化合物2在醋酸銅催化下與1發(fā)生N-芳基化得到化合物3。質(zhì)譜、核磁二維譜及二級質(zhì)譜確定修飾位點(diǎn)在組氨酸鄰位焦谷氨酸N上(此反應(yīng)與ChanLam偶聯(lián)反應(yīng)類似,但后者需要堿性條件且一般在無水環(huán)境中甚至加熱才能實(shí)現(xiàn))。進(jìn)一步的對照試驗(yàn)證明組氨酸殘基的存在*,且修飾專一發(fā)生在組氨酸前一氨基酸的氨基上。

 

得到此結(jié)果后,作者擴(kuò)大了肽鏈以及硼酸化合物的多樣性。如下圖所示,Leuprolide4)是一個(gè)與TRH類似N末端為Glp的多肽,對芳基硼酸及烯基硼酸的適應(yīng)性都非常好。而另一多肽angiotensin I5)相對比較惰性,但烯基硼酸對此多肽相對于芳基硼酸活性要好很多。另外由于angiotensin I另一H6組氨酸的存在,會(huì)有混合產(chǎn)物出現(xiàn),這也是此方法的一個(gè)缺陷(多個(gè)組氨酸存在影響定位)。

 

大招自然在zui后,嘗試了不同長度的多肽后,作者用了蛋白質(zhì)溶菌酶(lysozyme,∼14 kDa)作為底物,并選用三種不同的芳基三氟硼酸鹽(化合物1516、17)進(jìn)行14位精氨酸(15位為組氨酸)的定點(diǎn)修飾。化合物1516修飾的產(chǎn)物可以通過Click Chemistrycoumarin進(jìn)行熒光顯色(小小僧不明白為什么不直接用帶有coumarin的硼酸鹽做),化合物17可以與脫硫pull-down并通過affinity purification,得到的修飾后蛋白質(zhì)的分子量符合預(yù)期(因?yàn)橹挥幸粋€(gè)組氨酸所以是單一位點(diǎn)修飾)。

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